登革熱病毒造成每年數億人罹患又稱為「斷骨熱」的登革熱，不僅讓患者痛苦不堪，每年因其而死亡的人數還達到兩萬人之譜。
不過科羅拉多州立大學的一支研究小組使用 NVIDIA Tesla GPU，距離遏止目前尚屬不治之症的登革熱病毒在人體內進行複製的目標，又更近了一步。
科學家們在這三十年來在登革熱病毒裡發現非結構蛋白3（NS3）這種酶出現複製的情況，而使得登革熱病毒存活下來。但直到現在還沒有人能找到「結合位點」，讓藥物可以影響酶和抑制基因組複製，以避免病毒出現複製的舉動。
操控時間
過去在超級電腦上進行的 NS3 模擬結果，對科學家並沒有多大幫助。為了找到酶的結合位點，研究人員需要放大到分子等級，從外觀上模擬 NS3 的運作方式。但是最恰好的時間只有幾十到幾百奈秒，這個時間太短了，短到無法準確捕捉複製的過程。
這些問題代表目前用於抑制 NS3 的藥物，實際藥效還不夠明確，再加上會跟其它細胞蛋白質產生相互作用，可能也有著顯著的副作用。
NVIDIA GPU 幫助改變研究人員能看到的內容。
研究團隊在他們的研究裡指出聖地牙哥超級電腦中心搭載 Tesla GPU 的 Comet 與 Bridges 超級電腦，使得他們能更有效率地模擬酶的運動。尤其是先進的軟體和快速的計算速度，使得模擬時間減慢到微秒，較過去的模擬時間延長了100倍，僅使用 CPU 的超級電腦做不到如此出色的表現。
結果研究人員在 NS3 裡發現了一組氨基酸殘基，這些氨基酸殘基就像是馬口鐵罐電話一般，在輔酶與 RNA 間傳遞訊息，這是前所未見的情況。
研究團隊表示會繼續使用他們的模型來研究 NS3 酶的反應，它也在茲卡病毒和西尼羅病毒裡發揮作用。隨著精確度及圖形能力的精進，更深入的研究總有一天可能會阻止這些疾病進行傳播。
「NVIDIA GPU 等技術的發展，加上相應的軟體 Amber 有效利用了這項硬體，讓我們更有能力進行這些模擬。在理想的情況下，我們會繼續推動軟硬體的開發，最終在毫秒級的時間尺度進行調查，這跟生物學更具相關性。」科羅拉多州立大學助理教授，也是參與這項研究的研究員 Martin McCullagh 說。