病毒大戰全面展開:Folding @ Home獲得1.5 Exaflops算力來對抗COVID-19

作者 rick

Virus War Goes Viral: Folding@Home Gets 1.5 Exaflops to Fight COVID-19

https://blogs.nvidia.com/blog/2020/04/01/foldingathome-exaflop-coronavirus/

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病毒大戰全面展開:Folding @ Home獲得1.5 Exaflops算力來對抗COVID-19

Virus War Goes Viral: Folding@Home Gets 1.5 Exaflops to Fight COVID-19

多達 70 萬台家用電腦用戶下載軟體,幫助破解冠狀病毒中的代碼。

Folding@Home 是一個用於蛋白質動力學模擬的分佈式計算項目,為幫助應對 COVID-19 疫情,該項目通過眾源的方式,實現了超過 1 exaflop (每秒 1 百億億次浮點計算)的處理能力,以幫助 COVID-19 研究實現突破。

為了更直接地說明該算力有多麼強大,我們以 Summit 為例進行對比。 Summit 作為世界上速度最快的超級計算機,擁有 27,000 多塊 NVIDIA V100 GPU ,其正式運行時處理能力可達到 150 petaflops (每秒 150 千萬億次浮點計算),在進行 HPL-AI 基準測試時,其處理能力為 445 petaflops 。

短短幾天,就有近 40 萬名玩家捐贈了他們的 GPU 資源來搭建 Folding@Home 超級計算機。

科學家們將藉助於此計算力進行 COVID-19 的蛋白質動力學分析,並希望能夠藉此更好地了解那些有潛力使病毒失效的藥物如何相互作用。

其中,聖路易斯華盛頓大學( Washington University in St. Louis )的一組研究人員正在研究 COVID-19 的蛋白質折疊問題,蛋白質折疊是蛋白質鏈獲得其固有三維結構的物理過程。

“目前,測定蛋白質結構的實驗方法很多。雖然功能強大,但它們只顯示了蛋白質通常形狀的一個快照。然而蛋白質有很多活動的部分,因此我們更希望能夠看到蛋白質是如何相互作用的,”該組織在他們的網頁中表示:“這些計算需要極大的算力,任何一點支持都可以對研究起到幫助!每運行一次模擬就像是買一張彩票一樣,我們買的彩票越多,中獎的機會就越大。”

COVID-19 相關蛋白質的示例,通過 Folding@Home 實現可視化。

Folding@Home 項目組表示,該項目是第一個使用 GPU 進行分子動力學模擬的分佈式計算項目。

該組織表示:“對於某些類型的計算,我們可以看到,相比於基於 CPU 的同類產品, GPU 的速度提高了 20-30 倍。”

如果你想了解有關 Folding@Home 項目的更多詳細信息,捐贈你的 GPU 資源,請點擊文章底部“閱讀原文”。